Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430078G23RikE9Q7Y4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms