Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col22a1E9Q7P1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col22a1E9Q7P1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col22a1E9Q7P1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms