Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Simc1E9Q6E9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms