Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DspE9Q557 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms