Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
8030474K03RikE9Q4Y8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms