Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde8bE9Q4S1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde8bE9Q4S1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde8bE9Q4S1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pde8bE9Q4S1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde8bE9Q4S1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms