Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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