Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930579F01RikE9Q3L6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms