Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm3893E9Q1I1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms