Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms