Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fndc1E9Q043 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fndc1E9Q043 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms