Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ddx60E9PZQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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