Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ryr1E9PZQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms