Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf11E9PZM7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Scaf11E9PZM7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms