Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ift140E9PY46 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ift140E9PY46 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ift140E9PY46 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms