Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms