Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trim30bE9PVL6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim30bE9PVL6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms