Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6904E9PVF1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms