Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc175E9PVB3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc175E9PVB3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms