Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms