Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm5286E0CXI6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5286E0CXI6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5286E0CXI6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5286E0CXI6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5286E0CXI6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm5286E0CXI6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm5286E0CXI6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm5286E0CXI6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm5286E0CXI6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm5286E0CXI6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm5286E0CXI6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5286E0CXI6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm5286E0CXI6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm5286E0CXI6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm5286E0CXI6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5286E0CXI6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms