Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BC035044E0CXF8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BC035044E0CXF8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC035044E0CXF8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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BC035044E0CXF8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC035044E0CXF8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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BC035044E0CXF8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC035044E0CXF8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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BC035044E0CXF8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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BC035044E0CXF8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC035044E0CXF8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC035044E0CXF8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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BC035044E0CXF8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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