Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930467E23RikD3Z1P8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms