Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
3425401B19RikD3Z1D3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
3425401B19RikD3Z1D3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms