Protein–RNA interactions for Protein: D3YX03

Gm7849, Predicted gene 7849, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7849D3YX03 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7849D3YX03 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms