Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptprz1B9EKR1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprz1B9EKR1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms