Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd8B9EJ80 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd8B9EJ80 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd8B9EJ80 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd8B9EJ80 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms