Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms