Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6133B2RY53 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6133B2RY53 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6133B2RY53 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms