Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap58B2RW38 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap58B2RW38 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms