Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms