Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ythdc2B2RR83 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ythdc2B2RR83 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms