Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf3B2RQG2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms