Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn7aB1AYL1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms