Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prr29B1ARI9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms