Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem238A9JSM3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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