Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skint2A7XUX6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skint2A7XUX6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skint2A7XUX6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skint2A7XUX6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms