Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms