Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra4A2RT60 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms