Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AgrnA2ASQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AgrnA2ASQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AgrnA2ASQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms