Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef17A2ASJ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms