Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scn3aA2ASI5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scn3aA2ASI5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms