Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubb1A2AQ07 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms