Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GabreA2AMW3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GabreA2AMW3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms