Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FocadA2AKG8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FocadA2AKG8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FocadA2AKG8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms