Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VirmaA2AIV2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VirmaA2AIV2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms