Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ambra1A2AH22 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms