Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C87977A2A958 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C87977A2A958 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C87977A2A958 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C87977A2A958 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C87977A2A958 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms