Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef6A2A8M8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef6A2A8M8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef6A2A8M8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef6A2A8M8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef6A2A8M8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef6A2A8M8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef6A2A8M8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms