Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb4A2A863 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itgb4A2A863 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms